α-Fucosidose wordt veroorzaakt door een gebrek aan het enzym α-fucosidase, dat verantwoordelijk is voor de afbraak en het hergebruik van korte suiker- en eiwitketens in de lichaamscellen. Van deze korte ketens (oligosacchariden) zijn meestal grote hoeveelheden in de urine van de patiënt te vinden. Bij het vermoeden dat een patiënt α-fucosidose heeft, wordt de urine dus eerst getest. De definitieve bevestiging van de diagnose wordt gemaakt door de enzymactiviteit te meten in het bloed of een stukje huid van de patiënt.

Het is mogelijk om prenataal onderzoek te laten verrichtten wanneer er eerder een kind met α-fucosidose in de familie geboren is. Dat onderzoek heeft echter geen 100% betrouwbaarheid.