Het syndroom van Lesch-Nyhan is niet te genezen. Voor de neurologische symptomen van de ziekte is helaas ook geen behandeling die de symptomen kan voorkomen.
Het is wel mogelijk om de nier schade te beperken die wordt veroorzaakt door abnormale uitscheiding van urinezuur. Patiënten worden daarvoor behandeld met het medicijn Allopurinol.
Omdat de meeste patiënten mager zijn en matig groeien, krijgen zij vaak een dieet voorgeschreven met extra eiwitten en calorieën, vaak aangevuld met extra foliumzuur.

Het zelf verwondende gedrag van Lesch-Nyhan patiënten is in te perken met verschillende soorten maatregelen. Soms kan het nodig zijn de patiënt zo vast te zetten dat hij zichzelf het minst kwaad kan doen. Ook het trekken van enkele tanden kan de kans op zelfverwonding verminderen. Daarnaast kunnen begeleiders van Lesch-Nyhan patiënten inventief zijn in het vermijden van het gedrag, bijvoorbeeld door afleidingsmanoeuvres.