Op dit moment kan de ziekte van Alexander niet goed behandeld worden. Alles is gericht op het bestrijden van de symptomen van de ziekte, om patiënten zo aangenaam mogelijk te laten leven zolang het kan.

Verdere behandeling kan bestaan uit het gebruik van anti-epileptische medicijnen om de epileptische aanvallen onder controle te houden en het van antibiotica om infecties te voorkomen. Plaatsing van een PEG sonde (een slangetje dat rechtstreeks door de huid in de maag ligt) is vaak nodig om de voeding te garanderen.

Verder blijft controle door een team van specialisten belangrijk om complicaties op het gebied van voedingstoestand, groei, spasticiteit, contracturen (vergroeiingen) en communicatie te beperken en psychologische klachten te voorkomen.